MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerobacter thermophilus DSM 20745 chromosome 2

Total Repeats: 28047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013524	GT	3	6	76	81	0 %	50 %	50 %	0 %	269928380
2	NC_013524	GGC	2	6	111	116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928380
3	NC_013524	GAC	3	9	125	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928380
4	NC_013524	GC	3	6	159	164	0 %	0 %	50 %	50 %	269928380
5	NC_013524	CGGC	2	8	167	174	0 %	0 %	50 %	50 %	269928380
6	NC_013524	CAG	2	6	215	220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928380
7	NC_013524	ACG	2	6	259	264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928380
8	NC_013524	GGT	2	6	284	289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928380
9	NC_013524	CCGC	2	8	311	318	0 %	0 %	25 %	75 %	269928380
10	NC_013524	CG	4	8	421	428	0 %	0 %	50 %	50 %	269928380
11	NC_013524	CCG	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928380
12	NC_013524	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928380
13	NC_013524	GCC	2	6	495	500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928380
14	NC_013524	TCA	2	6	508	513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269928380
15	NC_013524	TCA	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269928380
16	NC_013524	GCG	2	6	584	589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928380
17	NC_013524	GTG	2	6	618	623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928380
18	NC_013524	ACG	2	6	634	639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928380
19	NC_013524	CG	3	6	638	643	0 %	0 %	50 %	50 %	269928380
20	NC_013524	CTT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269928380
21	NC_013524	CGGT	2	8	705	712	0 %	25 %	50 %	25 %	269928380
22	NC_013524	ACG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928380
23	NC_013524	CGC	2	6	788	793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928380
24	NC_013524	GGC	2	6	794	799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928380
25	NC_013524	CCTT	2	8	805	812	0 %	50 %	0 %	50 %	269928380
26	NC_013524	GGC	2	6	813	818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928380
27	NC_013524	GGC	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928380
28	NC_013524	GCGA	2	8	843	850	25 %	0 %	50 %	25 %	269928380
29	NC_013524	GCG	2	6	873	878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928380
30	NC_013524	GC	3	6	882	887	0 %	0 %	50 %	50 %	269928380
31	NC_013524	AGG	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928381
32	NC_013524	CG	3	6	1182	1187	0 %	0 %	50 %	50 %	269928381
33	NC_013524	GC	3	6	1285	1290	0 %	0 %	50 %	50 %	269928381
34	NC_013524	G	6	6	1293	1298	0 %	0 %	100 %	0 %	269928381
35	NC_013524	TCGA	2	8	1324	1331	25 %	25 %	25 %	25 %	269928381
36	NC_013524	TCG	2	6	1382	1387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928381
37	NC_013524	CAC	2	6	1593	1598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928381
38	NC_013524	GGT	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928381
39	NC_013524	GCG	2	6	1762	1767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928381
40	NC_013524	GGC	2	6	1797	1802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928381
41	NC_013524	TGG	3	9	1832	1840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928381
42	NC_013524	TGG	2	6	1877	1882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928381
43	NC_013524	CGGCG	2	10	1935	1944	0 %	0 %	60 %	40 %	269928381
44	NC_013524	CGT	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928381
45	NC_013524	CG	3	6	2080	2085	0 %	0 %	50 %	50 %	269928381
46	NC_013524	CGG	2	6	2109	2114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928381
47	NC_013524	GC	3	6	2281	2286	0 %	0 %	50 %	50 %	269928381
48	NC_013524	AGG	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928381
49	NC_013524	GGGTC	2	10	2358	2367	0 %	20 %	60 %	20 %	269928381
50	NC_013524	TCG	2	6	2405	2410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928381
51	NC_013524	TGCGG	2	10	2437	2446	0 %	20 %	60 %	20 %	269928381
52	NC_013524	CGA	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928381
53	NC_013524	CCG	2	6	2495	2500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928381
54	NC_013524	TCA	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269928381
55	NC_013524	AGG	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928381
56	NC_013524	TGCGA	2	10	3086	3095	20 %	20 %	40 %	20 %	269928382
57	NC_013524	GCC	2	6	3128	3133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928382
58	NC_013524	CGT	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928382
59	NC_013524	GAA	2	6	3177	3182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269928382
60	NC_013524	GCG	2	6	3188	3193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
61	NC_013524	GTT	2	6	3209	3214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269928382
62	NC_013524	CGG	2	6	3220	3225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
63	NC_013524	CCGCTG	2	12	3294	3305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	269928382
64	NC_013524	CAT	2	6	3353	3358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269928382
65	NC_013524	CG	5	10	3392	3401	0 %	0 %	50 %	50 %	269928382
66	NC_013524	CGG	2	6	3403	3408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
67	NC_013524	CCA	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928382
68	NC_013524	CGG	2	6	3456	3461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
69	NC_013524	AGC	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928382
70	NC_013524	CAGCCA	2	12	3500	3511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	269928382
71	NC_013524	CG	3	6	3678	3683	0 %	0 %	50 %	50 %	269928382
72	NC_013524	GGC	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
73	NC_013524	GATC	2	8	3713	3720	25 %	25 %	25 %	25 %	269928382
74	NC_013524	GCCGAT	2	12	3723	3734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	269928382
75	NC_013524	GGC	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
76	NC_013524	GGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928382
77	NC_013524	CG	3	6	4041	4046	0 %	0 %	50 %	50 %	269928382
78	NC_013524	CGG	2	6	4066	4071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
79	NC_013524	CAG	3	9	4158	4166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928382
80	NC_013524	GTG	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928382
81	NC_013524	GGC	2	6	4196	4201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
82	NC_013524	GAG	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928382
83	NC_013524	GCG	2	6	4259	4264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928382
84	NC_013524	CCG	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928383
85	NC_013524	GT	3	6	4491	4496	0 %	50 %	50 %	0 %	269928383
86	NC_013524	AGCGC	2	10	4579	4588	20 %	0 %	40 %	40 %	269928383
87	NC_013524	GTC	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928383
88	NC_013524	ACC	2	6	4613	4618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928383
89	NC_013524	CGG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928383
90	NC_013524	GTC	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928383
91	NC_013524	GTC	2	6	4872	4877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928384
92	NC_013524	CCG	2	6	4951	4956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928384
93	NC_013524	CAA	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269928384
94	NC_013524	GCC	2	6	5037	5042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928384
95	NC_013524	GATCGA	2	12	5090	5101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269928384
96	NC_013524	GTC	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928384
97	NC_013524	ACG	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928384
98	NC_013524	GGC	2	6	5226	5231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928384
99	NC_013524	GCC	2	6	5435	5440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928384
100	NC_013524	CCG	2	6	5451	5456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928384
101	NC_013524	GC	3	6	5523	5528	0 %	0 %	50 %	50 %	269928384
102	NC_013524	GC	3	6	5538	5543	0 %	0 %	50 %	50 %	269928384
103	NC_013524	CGG	2	6	5549	5554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928384
104	NC_013524	CTA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269928384
105	NC_013524	GCG	2	6	5677	5682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928384
106	NC_013524	CAC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928384
107	NC_013524	GCG	2	6	5842	5847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928384
108	NC_013524	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928384
109	NC_013524	GCCT	2	8	5886	5893	0 %	25 %	25 %	50 %	269928384
110	NC_013524	GAA	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269928384
111	NC_013524	CTG	3	9	5946	5954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928384
112	NC_013524	GTC	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928384
113	NC_013524	CTG	2	6	6008	6013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928384
114	NC_013524	CCGA	2	8	6053	6060	25 %	0 %	25 %	50 %	269928384
115	NC_013524	CCG	2	6	6094	6099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928384
116	NC_013524	CG	3	6	6098	6103	0 %	0 %	50 %	50 %	269928384
117	NC_013524	GAT	2	6	6216	6221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269928385
118	NC_013524	TTC	2	6	6230	6235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269928385
119	NC_013524	TGGG	2	8	6238	6245	0 %	25 %	75 %	0 %	269928385
120	NC_013524	CTC	2	6	6274	6279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269928385
121	NC_013524	CTT	2	6	6315	6320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269928385
122	NC_013524	CGG	2	6	6324	6329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928385
123	NC_013524	GCT	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928385
124	NC_013524	GGC	2	6	6342	6347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928385
125	NC_013524	CGG	2	6	6366	6371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928385
126	NC_013524	CGA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928385
127	NC_013524	GC	3	6	6398	6403	0 %	0 %	50 %	50 %	269928385
128	NC_013524	TCC	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269928385
129	NC_013524	TCC	2	6	6452	6457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269928385
130	NC_013524	GCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928385
131	NC_013524	ACC	3	9	6544	6552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928385
132	NC_013524	ACT	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269928385
133	NC_013524	CTG	3	9	6703	6711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928385
134	NC_013524	CGG	2	6	7046	7051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269928386
135	NC_013524	ACC	2	6	7070	7075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928386
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259	NC_013524	CG	3	6	13044	13049	0 %	0 %	50 %	50 %	269928391
260	NC_013524	TCT	2	6	13084	13089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269928391
261	NC_013524	AGG	2	6	13117	13122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928391
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263	NC_013524	ACC	2	6	13213	13218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269928391
264	NC_013524	GCC	2	6	13222	13227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928391
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266	NC_013524	ACG	2	6	13315	13320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928391
267	NC_013524	GGT	2	6	13325	13330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928391
268	NC_013524	GAC	2	6	13407	13412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928391
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372	NC_013524	GC	3	6	18278	18283	0 %	0 %	50 %	50 %	269928395
373	NC_013524	TCT	2	6	18289	18294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269928395
374	NC_013524	TGG	2	6	18387	18392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928395
375	NC_013524	CTAGCA	2	12	18396	18407	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269928395
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377	NC_013524	ACTGG	2	10	18476	18485	20 %	20 %	40 %	20 %	269928395
378	NC_013524	GAC	2	6	18553	18558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928395
379	NC_013524	CTGC	2	8	18759	18766	0 %	25 %	25 %	50 %	269928396
380	NC_013524	GTA	2	6	18790	18795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269928396
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382	NC_013524	AGC	2	6	18932	18937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928396
383	NC_013524	GAG	2	6	18946	18951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269928396
384	NC_013524	TGGT	2	8	18953	18960	0 %	50 %	50 %	0 %	269928396
385	NC_013524	CGA	2	6	18975	18980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269928396
386	NC_013524	CGT	2	6	18987	18992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269928396
387	NC_013524	CCG	2	6	19032	19037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269928396
388	NC_013524	GTG	2	6	19066	19071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269928396
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390	NC_013524	GC	3	6	19095	19100	0 %	0 %	50 %	50 %	269928396
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